阿弥陀寺は1239（延応元）年に真言宗の寺院として創建され、戦国時代初期の文明年間（1469〜87年）に蓮如上人が訪れたのを契機として浄土真宗に改宗しました。
　戦国の世には浄土真宗が東海地方に深く広がりを見せはじめ、尾張一帯における農民の多くが真宗に帰依しました。そうしたなか、室町期には当寺も末寺を抱えるほどの規模であったと伝えられています。しかし1570年（元龜１）に蜂起した伊勢長島の一向一揆に際し、当寺も門徒等とともにこれに加わりましたが、信長勢による弾圧にあい、寺の規模は大きく縮小させられました。その後、往来の要地である鎌倉街道にあって、東本願寺（大谷派）の重要な地方寺院として現在の規模にまで回復し、徳川中期（江戸時代中期）以降は、常陸国柿岡村如来寺の分地の二十四輩地としてその役を果たし今日に至ります。
　長島一揆での焼討ちや、二度の大戦によって、現在の阿弥陀寺は歴史的建造物としての指定は受けていませんが、かつての鎌倉街道は今も門前に残り、往時の繁栄がしのばれます。